健雲中醫管理系統中提供自定藥物功能，使中醫師能夠根據患者的特定需求和病情選用不同藥廠的藥物作為處方。 這個功能允許醫師根據診所需要，增設來自不同藥廠的藥物。

除藥物名稱外，使用者在介面中亦可加入英文名稱、拉丁名稱、牌子、份量、每日用量、產品編號、香港註冊編號、別名及成份。 個性化處理讓醫師選擇最適合病人的藥物，電腦系統同時能存儲和追蹤自定藥物的庫存記錄，以便醫師和診所助理隨時查詢和更新。

1. 進入「主頁」後，點擊左下方的「藥物設定」按鈕。　

  2. 跳至「藥物設定」頁面後，點擊頁面近右上角位置的「新增」按鈕以新增藥物。

  3. 點擊「新增」按鈕後，頁面會跳至表格，用戶需按指示填寫有關藥物的資料，例如：牌子、每日用量，產品編號等等。

4. 點擊「別名」欄最右方的按鈕以新增別名

5. 點擊新增別名之按鈕後，會在其下方彈出輸入列。只需在該格內輸入文字即可新增別名。

6. 點擊「成份」欄最右方的按鈕以新增成份。

7. 點擊新增成份之按鈕後，會在其下方彈出輸入列。

  8. 在「數量」格內輸入有關成份的數量。

9. 在「單位」格內輸入有關成份的數量單位。

10. 點擊「成份」輸入列下方的加號按鈕以新增成份。

11. 點擊加號按鈕後，會彈出「成份設定」表格，點擊所含的成份按鈕即可新增成份。

12. 完成後點擊頁面的空白位置以退出「成份設定」表格，即可回到「藥物設定」頁面。

然後點擊頁面右下角的「儲存」按鈕以儲存所新增的藥物設定資料。

13. 點擊「儲存」後，頁面會顯示用戶所新增的藥物設定，即已更新有關資料。